Mi bloque de navegación en mi article.html no está enlazando a los enlaces sobre nosotros, artículos o contacto. Mi código está abajo.

He organizado tu código abajo de una manera más legible para que podamos discutirlo mejor si es necesario.

El error que estás recibiendo sugiere que estás vinculando a un archivo que no existe. Cada vez que antepones el nombre del archivo con ../ básicamente estás diciendo retrocede (o sube) un nivel de directorio en tu estructura.

<nav>
  <ul>
    <li><a href=../../index.html>Inicio</a></li>
    <li><a href=../../index.html#about>Acerca de</a></li>
    <li><a href=../../index.html#articles>Artículos</a></li>
    <li><a href=../../index.html#contact>Contacto</a></li>
  </ul>
</nav>

Entonces, para responder tu pregunta, si estás recibiendo el error "La URL solicitada /index.html no se encontró en este servidor.", eso sugiere que tu archivo index.html no está 2 niveles de directorio atrás (o arriba) del archivo que contiene este código. Para corregirlo, si el index.html está en la raíz, elimina los 2 ../ rutas y ve por una sola / en su lugar. Si solo es 1 nivel de directorio de diferencia, solo elimina uno.

<nav>
  <ul>
    <!-- Si el archivo index.html está en la raíz, intenta esto -->
    <li><a href=/index.html>Inicio</a></li>

    <!-- Si es solo un nivel de directorio atrás, intenta esto -->
    <li><a href=../index.html#about>Acerca de</a></li>

    <!-- Si está en el mismo nivel de directorio que este archivo, intenta esto -->
    <li><a href=index.html#articles>Artículos</a></li>

    <!-- Si está 3 niveles atrás en la estructura, intenta esto -->
    <li><a href=../../../index.html#contact>Contacto</a></li>
  </ul>
</nav>

Espero que esto ayude pero si necesitas más consejos o ayuda, avísame y estaré feliz de explicar mejor y/o investigar más a fondo el problema que estás teniendo.

No me dejará editar mi pregunta pero el error que estoy recibiendo está abajo.

La URL solicitada /index.html no se encontró en este servidor.

¡Gracias por responder tan rápido! Así que intenté los ejemplos que presentaste y mi estructura de carpetas es (Carpeta) articles-->2017-->article.html, así que asumiría que sería ../../index.html, ¿verdad? Por alguna razón sigue apareciendo no encontrado. Mi index.html está en la carpeta principal (¿raíz?). Todos mis otros enlaces que van a mi archivo article.html funcionan sin problemas pero es solo el retroceso lo que me está causando problemas en todos mis enlaces.

¡Gracias de nuevo por ayudarme!